Prof. Dr. Nizami Mustafa’nın Kütahya Dumlupınar Üniversitesinde ki akademik hayatı 15 Eylül 2003 tarihine kadar devam ederken, Kars’ta bulunan Kafkas Üniversitesi’ne 16 Eylül 2003 tarihinde gelerek Fen Edebiyat Fakültesi Matematik Bölümü’nün kurucuları arasında yerini alır. Kafkas Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Matematik Bölümü’nde 2006 ile 2013 yılları arasında yedi yıl Bölüm Başkanlığı görevini yürüten Prof. Dr. Nizami Mustafa daha sonrasında Matematik Bölümünde Analize Fonksiyonlar Teorisi Ana Bilim Dalı Başkanlığı görevini üstlenir.
Kars’ta 14 yıldır akademik hayatına devam eden ve buraya yerleşen Prof. Dr. Nizami Mustafa 31 Aralık 2004 tarihinde Türk vatandaşlığına kabul edilirken, evli ve üç çocuk sahibidir.